Методрекомендации распространяются на медорганизации, осуществляющие вакцинацию, они не касаются процесса информирования работников, обязанность организовать который возложена на работодателя. На наш взгляд, корректной является ситуация, когда гражданин (он же ваш работник) приходит на пункт вакцинации с результатами анализов и уже там получает справку, что вакцинация в настоящий момент не показана. Это однозначно не компетенция работодателя, даже если юрлицо-работодатель осуществляет медицинскую деятельность. Ваша задача — проинформировать. Информировать Вы обязаны всех работников, вне зависимости от титров антител.